Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNDIG1LA6NDD5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms