Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC66A2RUB6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms