Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MIR6760-201ENST00000617342 68 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AP000457.1-201ENST00000620221 378 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AP000787.3-201ENST00000634407 307 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 IL22RA2-202ENST00000339602 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LMOD1-201ENST00000367288 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ASPA-201ENST00000263080 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NFIB-219ENST00000636735 1471 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SYNJ2-204ENST00000367122 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CLNK-202ENST00000442825 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 BECN1-202ENST00000438274 1569 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PARM1-201ENST00000307428 5011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AFF2-205ENST00000370460 13746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL596275.2-201ENST00000641749 1706 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CYP2C9-201ENST00000260682 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PPID-201ENST00000307720 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TRAF1-203ENST00000546084 3715 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PIK3C2B-202ENST00000367187 7686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LINC01641-202ENST00000445817 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TTC39A-201ENST00000262675 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SLCO2B1-201ENST00000289575 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 HS6ST3-202ENST00000620595 7073 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FNBP1L-201ENST00000260506 5341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MX1-203ENST00000398600 3470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FCGR2A-201ENST00000271450 2412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CARMIL1-201ENST00000329474 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 C11orf54-201ENST00000331239 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TRBV7-6-201ENST00000390374 392 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CEBPZOS-202ENST00000397064 568 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NXNP1-201ENST00000397383 1051 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MYO7B-201ENST00000409090 3567 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AP002748.4-201ENST00000419755 3547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL139246.1-201ENST00000424657 455 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC010731.1-201ENST00000426087 846 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FXYD6P2-201ENST00000444174 288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FGF14-AS1-201ENST00000444686 294 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC000067.1-201ENST00000452326 287 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ALDH7A1P2-201ENST00000456501 621 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RN7SL484P-201ENST00000462651 202 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RN7SL737P-201ENST00000490246 282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RNU4ATAC12P-201ENST00000516460 113 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NFRKB-205ENST00000526940 539 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC105219.3-201ENST00000527579 374 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC068768.1-202ENST00000541002 1110 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NINJ2-205ENST00000542920 670 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC136443.3-201ENST00000546674 676 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FMN1-207ENST00000559047 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ULK4P2-205ENST00000570221 634 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RN7SL408P-201ENST00000577207 296 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC087164.1-201ENST00000577847 513 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CYP2A7P2-201ENST00000600605 641 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.92-201ENST00000613789 329 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LARS-216ENST00000618084 720 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC145285.8-201ENST00000619561 255 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC025279.3-201ENST00000622398 104 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AJ003147.3-201ENST00000622989 2199 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CU634019.3-201ENST00000623962 2456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FP236315.2-201ENST00000624506 2456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FP671120.2-201ENST00000624806 2456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC026362.2-201ENST00000624878 5566 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PXYLP1-207ENST00000508812 4158 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NEDD1-203ENST00000429527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ABLIM3-205ENST00000504238 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NCAPD3-214ENST00000534548 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NEUROD6-201ENST00000297142 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC073539.1-201ENST00000599810 2094 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NR2C1-202ENST00000333003 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZSCAN25-202ENST00000334715 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ARMC8-218ENST00000485396 1920 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ABCC2-201ENST00000370434 1714 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PANX3-201ENST00000284288 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CRX-201ENST00000221996 4470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ABCC11-201ENST00000353782 4463 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RFPL1-201ENST00000354373 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SRGAP2C-202ENST00000367123 7204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC092683.1-204ENST00000610408 2830 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC159540.2-202ENST00000613749 2830 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TAF9B-201ENST00000341864 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF138-202ENST00000359735 2679 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms