Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 PRRG3-201ENST00000370353 5977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 GRIA1-201ENST00000285900 5708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ELAVL4-204ENST00000371823 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 STYK1-201ENST00000075503 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC110079.1-201ENST00000567913 4395 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NOL8-201ENST00000358855 4422 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RBM19-203ENST00000545145 4422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SEZ6L-204ENST00000402979 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DDX24-202ENST00000544005 2214 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RACGAP1-201ENST00000312377 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LRRTM2-202ENST00000518785 1958 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NWD1-204ENST00000524140 7641 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ANAPC16-204ENST00000615507 3100 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MED23-205ENST00000368068 5233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MED23-204ENST00000368060 4446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZDHHC15-203ENST00000541184 6012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FADS1-211ENST00000536991 2701 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TTLL7-201ENST00000260505 7976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 KBTBD4-201ENST00000395288 2460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC114689.1-201ENST00000578727 2484 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CLIP1-203ENST00000361654 5568 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RCAN1-210ENST00000487990 2520 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SKP217-201ENST00000364640 340 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ADD3-AS1-201ENST00000369655 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SKP65-201ENST00000410278 313 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SKP252-201ENST00000411210 327 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC092373.1-201ENST00000414951 490 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL157401.1-201ENST00000419836 344 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 VN2R9P-201ENST00000431428 953 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC244098.1-201ENST00000436499 275 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL583808.1-201ENST00000445976 499 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPSAP36-201ENST00000465940 869 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC034207.1-201ENST00000506742 948 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC091180.2-203ENST00000507337 601 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC008525.1-201ENST00000508719 676 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RNU2-24P-201ENST00000516830 143 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC008014.1-201ENST00000551503 829 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC104041.1-201ENST00000560054 569 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FRG2KP-202ENST00000568403 827 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL615P-201ENST00000584065 298 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF426-203ENST00000589289 919 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AF038458.3-201ENST00000592518 500 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC104113.1-201ENST00000607723 479 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HIST1H4G-201ENST00000611444 297 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SPATA31E1-201ENST00000325643 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ITM2A-201ENST00000373298 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC00838-201ENST00000562956 2936 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CSTF1-201ENST00000217109 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC027613.1-202ENST00000513136 1957 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NFATC2IP-203ENST00000564978 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HNRNPKP1-201ENST00000510896 1379 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 COPZ1-212ENST00000551779 1462 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ARHGEF9-233ENST00000637520 5682 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DPP9-203ENST00000594671 3851 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC112206.2-203ENST00000513234 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 EXOSC2-211ENST00000546165 1956 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AP1G1-202ENST00000393512 3593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC02042-201ENST00000481624 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TTTY11-201ENST00000253470 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CSH1-202ENST00000329882 1073 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 HSD17B7-202ENST00000367913 666 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 GAPDHP72-201ENST00000402643 1010 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RPL35P3-201ENST00000403133 371 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 KYNU-204ENST00000410015 776 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL606490.5-201ENST00000413071 760 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC018638.1-201ENST00000414464 330 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FAM133B-202ENST00000427372 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC016738.2-201ENST00000439150 493 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL606462.1-201ENST00000447187 451 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC023141.2-201ENST00000449138 550 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 COA4-206ENST00000545127 922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DIO2-211ENST00000557125 517 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC104770.1-202ENST00000573698 325 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC106774.9-201ENST00000638668 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms