Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQK5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQK5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQK5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQK5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQK5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQK5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQK5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQK5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQK5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms