Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms