Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA3Q9Y6H8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA3Q9Y6H8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms