Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB2Q9Y5E7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms