Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRRAPQ9Y4A5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms