Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REXO2Q9Y3B8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REXO2Q9Y3B8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REXO2Q9Y3B8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms