Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRG3Q9Y2Y8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRG3Q9Y2Y8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms