Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms