Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHKBQ9Y259 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHKBQ9Y259 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms