Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms