Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM35Q9UPQ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms