Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF8Q9UPP1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF8Q9UPP1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms