Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI3Q9ULW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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