Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms