Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO3Q9UK99 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms