Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP21Q9UK80 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms