Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms