Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUF60Q9UHX1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUF60Q9UHX1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms