Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX25Q9UHL0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX25Q9UHL0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms