Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX20Q9UHI6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms