Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF1Q9UBU9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms