Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFIP11Q9UBB9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TFIP11Q9UBB9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms