Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL42Q9P2K6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms