Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms