Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZSWIM5Q9P217 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSWIM5Q9P217 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms