Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCHIP1Q9P0W5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCHIP1Q9P0W5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms