Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms