Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP5Q9NZZ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms