Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA3Q9NZ52 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms