Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP6Q9NYH9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP6Q9NYH9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms