Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZDHHC3Q9NYG2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms