Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms