Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK13-1Q9NX77 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms