Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ASF1BQ9NVP2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms