Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJC11Q9NVH1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJC11Q9NVH1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms