Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO28Q9NVF7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms