Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDREJQ9NTG1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms