Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK0

KLC4, Kinesin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC4Q9NSK0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLC4Q9NSK0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLC4Q9NSK0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms