Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOPORSQ9NS56 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms