Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR2

TPSG1, Tryptase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPSG1Q9NRR2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPSG1Q9NRR2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPSG1Q9NRR2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms