Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms