Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FZD3Q9NPG1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms