Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTA1Q9NP79 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms