Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB9Q9NP78 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ABCB9Q9NP78 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms