Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPF2Q9HAU5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms