Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms